1. Majelis Ta’lim a. Untuk Para Santri.
Majelis Ta’lim untuk para santri ini diadakan tiap hari dan malam.
Adapun proses belajar/mengajar diwaktu hari di bagi menjadi tiga waktu, yaitu sesudah shubuh s/d jam 07.15 am WIB, jam 08.30 am s/d 10.00 am WIB, dan jam 10.30 am s/d azan Dhuhur.
Adapun untuk para santri tingkat ‘aliyah, ada penambahan jam belajar yaitu mulai sesudah dhuhur s/d jam 03.00 pm WIB.
Sedangkan waktu belajar/mengajar malam hanya satu waktu yaitu sesudah maghrib s/d jam 09 pm WIB. Untuk para santri tingkat ‘aliyah, ada penambahan jam belajar malam yaitu mulai jam 09.30 pm s/d jam 00.00 WIB.
b. Untuk penduduk sekitar dayah ( orang-orang tua ).
Majelis Ta’lim untuk para penduduk sekitar dayah (orang-orang tua) ini dilaksanakan hanya 1 kali setiap minggu yang pimpin langsung oleh Pimpinan Dayah Tgk Atasykuri M. Hm.
2. Melaksanakan pendidikan wajardikdas untuk tingkat paket B setara SMP / MTs dan Paket C setara SMA / MA yang diselenggarakan oleh Kementrian Agama ( Kemenag ).
3. Mengadakan pelatihan keahlian hidup ( Life Skile ), berupa pelatihan komputer, aplikasi dan pemograman komputer, pelatihan kaligrafi Arab, dan pertukangan,
Kitab yang diajarkan di Dayah Madinatul Fata ini adalah kitab kuning, sebagaimana yang telah dilaksanakan di dayah dayah salafiah dan yang tidak bertentangan dengan i’tiqad Ahlussunnah Wal Jama’ah. Kurikulum yang dipakai di dayah Madinatul Fata ini disusun sesuai kebutuhan, seperti kurikulum yang umumnya dipakai di dayah-dayah salafiah diseluruh Aceh.
